Program Studi Perbandingan Madzhab UNIDA Gontor lahir pada tahun 1995. Program Studi ini bertujuan untuk mencetak sarjana muslim yang piawai dalam ilmu syari’ah dan ilmu hukum. PSPM mengkaji berbagai madzhab yang diakui (madzhab hanafi, maliki, syafi’i, dan hambali) tanpa mengesampingkan bahwa madzhab syafi’i adalah madzhab yang terbesar di Indonesia yang mempengarui fatwa fatwa dan syari’at Islam di Indonesia. PSPM diorientasikan untuk melakukan islamisasi terhadap hukum yang berlaku di Indonesia baik dalam proses pembentukannya, penerapan dan penegakan hukumnya, akibatnya studi studi hukum Islam dan hukum Indonesia dilakukan secara integratif setelah menghapuskan nilai nilai barat yang sekuler. selain itu PSPM didukung oleh dosen-dosen dan mahasiswa yang bermadzhab syafi’i sehingga kurikullum program studi diarahkan untuk memperkuat karakter madzhab syafi’i dan memberikan sikap yang patut atau (flexibility) atas perbedaan dikalangan ahlu sunnah wal jama’ah.